党委（院长）办公室

纪委、监察专员办公室

党委巡察工作办公室

党委组织部

党委宣传部

党委统战部

审计处

离退休处(关工委)

发展规划处(学科建设办公室)

党委医院工作部、医院管理处

教务处(创新创业学院)

科研处

党委保卫部、保卫处（人民武装部）

党委教师工作部、人事处

党委学工部、学生工作处

财务处

国有资产管理处

国际合作与交流处(国际教学部 ...

后勤管理处

教学质量监控与评估处

教师发展中心

工会

团委

科研中心

基础医学院

公共基础学院

马克思主义学院

临床医学院

继续教育学院

研究生院

体育艺术部

检验医学院

护理学院

医学影像学院

药学院

公共卫生学院

生命科学学院

精神卫生学院

卫生管理学院

口腔医学院

全科医学系

安徽省全科医学发展研究中心

图书馆

网络信息中心

校医院

学报编辑部

第一附属医院(第一临床学院)

第二附属医院(第二临床学院)

直属淮北人民医院